Miałem podobny problem - z polskimi znakami. Nie potrzebuję generować PDFów ani RSSów, więc w tej kwestii nie szukałem rozwiązania - podane niżej może nie zadziałać.
Generowanie słów kluczowych w tytułach i meta keywords naprawia sugestia pietroverde umieszczona na http://extensions.joomla.org/extensions/1830/details (opis doprecyzowałem):
W pliku JoomSEO.php w funkcji GetKeywords() należy zamienić wiersz nr 368 (wersja 1.5.2 pluginu):
Kod PHP:
$text = strtolower($text);
na
Kod PHP:
$text = mb_strtolower($text,"utf-8");
i działa Oczywiście zmodyfikowany plik trzeba umieścić na serwerze (nadpisać) oryginalną wersję.