Możliwe, że podpowiedź @trzepiza coś da, chociaż wątpię.
To, że masz jakiś skrypt w php, na dodatek z jakimś panelem administrowania, to informacja typu: mam niewiadomoco do wyposażenia niewiadomoczego. Reszta jest tylko konsekwencją: jak to niewiadomoco do niewiadomoczego użyć w Joomla.
Najprostsza odpowiedź, brzmi, pewno niestety dla Ciebie, zlecić programiście PHP, żeby ten skrypt przerobił na dodatek (wtyczkę) do Joomla.