Witam, problem rozwiązałem wprowadzając zmiany w wielkości plików oraz szybkości wykonywania kopii (slow).
Proponuje zainstalować najnowszego Akeeba Backup (na dzień dzisiejszy najnowsza wersja to 3.0a5, jest w fazie beta ale działa poprawnie) i wszystko będzie działać jak trzeba na ustawieniach domyślnych (wystarczy zmienić katalog zapisu kopii)