Znalazłem rozwiązanie na instalację Joomali na mysql 5.5.8 więc:
1.Trzeba skonfigurować folder installation
2.Wchodzimy do folderu installation - sql - mysql otwieramy wszystkie pliki po kolei w dowolnym edytorze i szukamyi zamieniamy każdy taki kod naKod:TYPE=MyISAMi zapisujemy.Kod:ENGINE=MyISAM
3.Otwieramy każdy plik z tego folderu mysql i zastępujemy kodem powyżej. Gdy już skończymy wrzucamy folder instalacyjny do reszty plików i instalujemy na pewno zadziała sam próbowałem.
Edit: Jeżeli się będzie instalować dodatki to trzeba zwrócić uwagę na to czy dana wtyczka\komponent nie dodaje danych do bazy danych za pomocą TYPE. Jeżeli tak będzie to trzeba to zmienić na ENGINE.