Kod:
RewriteRule ^index.php$ - [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
Pozbędziesz się indexu ale poco tak jak można właczyć adresy z przedrostkiem i niebędzie wywoływany index.php
Poza tym za bardzo kombinujesz mi się wydaje ;)