Witaj,
a nie korzystasz przypadkiem z jakiegoś komponentu, który zbiera statystyki odwiedzin ? Kiedyś podobną sytuację miał jeden z moich klientów. To było jeszcze na wersji 1.0.x i korzystał bodajrze z JoomlaStats. Strasznie zapchał bazę, a każde nowe odwiedziny powodowały dodanie nowych wpisów do DB. Później niestety dostał blokadę od Admina. Po usunięciu komponentu i przełączeniu się na Google Analytics wszystko było ok
Pozdrawiam.