W katalogu /installation/sql/mysql/ są pliki z rozszerzeniem .sql. Konkretnie chodzi o joomla.sql, joomla_backward.sql i sample_data.sql. Otwórz sobie te pliki w edytorze tekstowym (np. Notepad++) i pozmieniaj wszystkie TYPE na ENGINE, czyli zamiast
TYPE=MyISAM CHARACTER SET `utf8`
ma być
ENGINE=MyISAM CHARACTER SET `utf8`