Numer wersji Joomla! nie ma tu najmniejszego znaczenia, a jeżeli już ma to na pewno nie w tym kierunku co sugerujesz, na pozycje strony ma wpływ suma wielu czynników np: domena, semantyka strony, współczynnik odrzuceń, czas przebywania użytkownika na stronie, głębokość odwiedzin, PR, itd. ale to nie te forum. Na pewno nie odpowiada za to wersja Joomla!, jedyne na co musisz zwrócić uwagę to aby struktura url została taka sama, w tedy nie strasz swojej pozycji w Google.