Jaki edytor używasz? Prawdopodobnie to edytor czyści iframe. Przełącz na CodeMirror, lub zainstaluj inny edytor np. TinyMCE i usuń w zabronionych elementach iframe (plugin edytot-TinyMCE). Lub szukaj rozwiązania dla edytora JCE (domyślny w joomla).